新疆军区总医院地处美丽的乌鲁木齐,有着悠久的历史和光荣的传统。医院1949年整编建院，是一所集医疗、科研、教学、预防、保健为一体的大型三级甲等综合性医院，担负全区部队官兵医疗保障任务，并致力于服务全疆各族人民。

在新时期改革强军中，医院转型重塑、焕新启航，医疗力量空前壮大，保障范围跨越天山南北，辐射藏北高原。医院（含所属中心医院、医疗区）总占地面积172.16万平方米，年门诊量258万余人次。拥有首批全军临床重点专科1个（眼科）、全军医学专科（病）中心6个（消化内科中心、骨科中心、睡眠障碍诊治中心、临床检验诊断中心、眼科中心和计划生育优生优育指导中心）、全军医药卫生科技查新站1个、自治区重点实验室1个（新疆特殊环境医学重点实验室）、全国全军培训示范基地8个，现为陆军军医大学、空军军医大学、新疆医科大学、石河子大学医学院的教学医院和研究生联合培养点，设有博士后科研工作站1个。